비영리회계 실무, 무엇부터 챙겨야 할까? 후원금부터 세무신고까지 정리

비영리회계 실무, 무엇부터 챙겨야 할까? 후원금부터 세무신고까지 정리

비영리회계 업무를 이제 막 시작하셨거나,
일반 영리 기업에서 비영리법인으로 이직하신 담당자님이라면 공감하실 내용입니다.

비영리법인의 회계는 일반 기업 회계와 달리 목적과 구조부터 근본적으로 다릅니다.

영리 기업이 이익을 창출해 주주에게 배분하는 것을 목표로 한다면,
비영리법인 회계의 핵심은 사회적 가치를 위해 조성된 자금을 얼마나 투명하고 효율적으로 사용했는지를 증명하는 데 있습니다.

 

특히 비영리단체는
외부 후원금과 정부 보조금을 기반으로 운영되는 경우가 많아,
단 1원의 오류도 허용되지 않는 높은 투명성과 회계 전문성이 요구됩니다.

 

그럼에도 불구하고 많은 담당자님들께서
“비영리회계는 너무 특수해서 참고할 실무 자료가 부족하다”,
“고유목적사업과 수익사업을 어떻게 구분해야 할지 헷갈린다”는 어려움을 자주 말씀하십니다.

 

여기에 더해 최근에는
공익법인에 대한 세법상 관리·감독이 지속적으로 강화되고 있어,
작은 회계 실수 하나가 가산세 부과는 물론 단체의 신뢰도 하락으로 이어질 수 있다는 부담도 커지고 있습니다.

 

이러한 실무 고민을 덜어드리기 위해, 오늘은 [얼마에요 비영리]와 함께
비영리법인 경리·회계 담당자님들이 반드시 알아야 할

• 계정과목 설정
• 후원금 관리
• 연말결산과 공시 제도

까지, 비영리회계 실무의 핵심 포인트를 단계별로 정리해보겠습니다.

 

 

 

1. 고유목적사업 vs 수익사업 계정과목부터 잡기

비영리회계 실무의 기본은 우리 단체의 활동을 고유목적사업과 수익사업으로 명확히 구분하여 장부를 구성하는 일이에요.

​

비영리단체는 수익을 추구하는 일반 기업과 달리 설립 목적에 따른 공익적 활동 중심의 고유목적사업이 기본이에요. 따라서 회계처리 시에도 관련 계정과목을 정확히 설정해야 재무제표, 공시, 세무 신고 과정에서 오류를 줄일 수 있어요.

구분	고유목적사업	수익사업
주요 수입	후원금, 보조금, 회원 회비	판매 수익, 수수료, 임대료
회계 처리	공익법인 회계기준 적용	기업 회계기준 원칙 적용
세무 의무	원칙적 법인세 면제 (예외 있음)	법인세 및 부가세 신고 의무 발생
관리 포인트	사용 목적에 따른 지출 증빙 철저	영리 기업과 동일한 원가 관리

고유목적사업은 법령이나 정관에 명시된 단체 본연의 목적을 달성하기 위한 사업을 말해요. 여기서 발생하는 수입은 후원금, 보조금, 회비 등이 대표적이며, 지출은 사업비와 관리비로 구성돼요.

​

반면 수익사업은 제조, 판매, 서비스 등 영리 활동을 통해 수익을 얻는 사업을 뜻해요. 예를 들어 복지관에서 운영하는 카페나 협회에서 발행하는 유료 잡지 광고 수익 등이 여기에 해당하죠.

​

실무자가 가장 흔히 하는 실수는 두 사업에서 공통으로 발생하는 비용인 '공통비용'을 배분하는 과정에서 생겨요. 사무실 임차료나 공과금, 인건비가 두 사업 모두에 걸쳐 있다면 매출액 비율이나 종업원 수 비율 등 객관적인 기준으로 나누어 장부에 기록해야 해요.

​

그래서 국세청과 세법은 고유목적사업과 수익사업을 반드시 구분경리(회계를 분리 처리)하라고 요구하고 있는데요. 그 이유는 간단합니다.

​

• 법인세: 비영리법인의 법인세 과세 대상은 기본적으로 수익사업에서 발생한 소득이고, 고유목적사업 수입·지출은 별도로 관리해 비과세 영역으로 분리해야 해요.
• 부가가치세: 재화·용역을 공급하는 수익사업 부분만 부가세 과세·신고 대상이 되며, 순수 고유목적사업은 부가세 대상이 아닌 경우가 많아요.

​

계정과목을 다음과 같이 큰 틀로 나누어 시작하면 좋아요.

구분	주요 계정 예시	세무상 처리
고유목적사업 수입	회비수입, 후원금수입, 보조금수입, 참가비수입 등	고유목적사업 계정으로 관리, 수익사업과 분리
수익사업 수입	임대료수입, 판매수입, 교육수입 등	법인세·부가세 과세 대상
고유목적사업비	장학금, 사업집행비, 프로그램운영비 등	고유목적사업준비금과 연계 관리
수익사업비	매출원가, 판매비, 관리비 등	수익사업 손익계산서에 반영

연초에 “우리 법인은 어떤 활동이 고유목적사업이고, 어떤 활동이 수익사업인지”를 정관·사업계획서와 함께 한 번 정리해 두는 일만으로도, 이후 회계·세무 판단의 70% 이상이 훨씬 수월해져요.

​

고유목적사업과 수익사업을 섞어서 처리하면, 법인세·부가세 신고 때 과세 범위가 꼬이고, 고유목적사업준비금 계상도 어려워질 수 있으니 초기에 잘 설정하는 게 정말 중요해요.

​

 

 

2. 후원금·보조금 증빙관리와 기부금영수증 발급 등 월별 루틴

비영리법인은 후원금과 보조금은 그 출처와 사용처를 명확히 입증해야 하므로 증빙과 관련된 월별 루틴 업무를 철저히 관리해야 해요.

​

특히 후원금은 비영리법인 사업자에게 기부 행위에 대한 증빙 의무가 있어, 후원자에게 발급하는 기부금영수증의 정확성과 발급 시점이 매우 중요해요.

​

월별로 꼭 챙겨야 할 루틴은 다음과 같아요:

​

1) 입금 확인 및 분류

• CMS·자동이체·카드 후원금 입금 내역을 매월 말 기준으로 집계
• 후원금, 보조금, 기타 수입 등 각 수입 항목별로 입금 내역을 분류
• 후원자 명부와 대조하여 미납이나 오입금이 없는지 확인
• 특히 지정후원금은 후원자가 정한 목적 이외의 용도로 사용되지 않도록 별도의 프로젝트 코드를 부여해 관리하는 것이 안전
• 익명·무기명 기부는 별도 계정으로 관리하고 기부금영수증 발급 대상에서 제외
• 계정과목별로 정확히 입력

​

2) 증빙 수집

• 현금·계좌이체 영수증
• 후원자 정보 및 목적 지정 여부
• 보조금의 경우 계약서 및 증빙 파일 저장

​

3) 기부금영수증 발급

• 발급 기준 및 금액 확인
  • 지정기부금단체로 등록된 기관만이 세액공제용 기부금영수증을 발급할 수 있음
• 발급 시점과 수신자 정보 입력
• 영수증에는 단체명·사업자등록번호·기부자 인적사항·기부일자·금액·유형 등이 필수로 포함돼야 함
• 매월 기부자의 성명, 주민등록번호, 기부 금액 정보를 정확하게 전산에 입력
• 기부금 영수증 발급대장을 반드시 작성하고 5년간 보관해야 할
• 필요 시 국세청 연계 발급 데이터 확보

​

4) 월별 정리 및 보고

• 월별로 후원금·보조금 명세서 작성
• 내부 결산 자료로 수입 누락 방지

​

기부금영수증은 재무제표상 수익인식 시점과도 연결돼 있어요. 특히 보조금은 단순 기부금과 구분해야 하며, 재무제표 작성과 결산공시에도 각각 적절히 반영해야 해요.

​

보조금은 전용 카드를 사용하고 지출 시마다 즉시 증빙을 매칭해야 결산 때 고생하지 않아요. 영수증은 가급적 스캔하여 디지털 데이터로 보관하고, 카드 전표 외에도 전자세금계산서나 현금영수증 등 적격 증빙을 갖추었는지 매월 말 검토하세요.

​

인건비 지출 시에는 원천세 신고와 4대 보험 납부를 기한 내에 마치는 것도 기본이죠. 매달 말일에는 월간 결산 보고서를 작성해 예산 대비 집행률을 점검해 보세요.

​

이를 통해 연말에 자금이 몰리거나 부족해지는 상황을 미연에 방지할 수 있으며, 이사회나 외부 이해관계자에게 신뢰를 줄 수 있는 탄탄한 실무 기반을 닦을 수 있답니다.

 

어렵고도 복잡한 비영리법인 회계

👉 쉽고 알찬 비영리 특화 회계프로그램 얼마에요 비영리에 맡겨보세요! [클릭]

​

얼마에요 비영리 ㅣ 협동조합, 공익법인 등 비영리 특화 ERP 프로그램

 

 

 

3. 비영리법인 세무 핵심: 법인세·부가세 신고 구분과 실무 일정표 관리

비영리법인이라고 해서 세금과 완전히 무관하지 않습니다.

​

기본적으로 공익 목적의 고유목적사업 수익은 법인세 면제 대상일 수 있지만, 수익사업을 하고 있다면 법인세와 부가세 세무 신고 대상이 될 수 있어요. 이에 따라 세무 일정을 미리 잘 관리해야 합니다. 공익법인이라면 상속세·증여세법상 결산서류와 출연재산 보고·공시 의무도 함께 져야 해요.

​

법인세 측면에서는, 비영리법인의 과세 대상은 기본적으로 ‘수익사업에서 발생한 소득’이에요. 고유목적사업에서 발생한 수입은 별도의 고유목적사업 계정으로 관리하고, 수익사업 손익과 섞이지 않도록 구분경리해야 해요.

​

사업연도 종료 후 3개월 이내(예: 12월 결산이면 익년 3월 말까지) 관할 세무서에 법인세 확정신고를 해야 하고, 수익사업 손익, 기부금 명세, 고유목적사업준비금 계상 내역 등을 포함한 서류를 제출해야 해요.

​

부가가치세는 재화·용역의 공급에 대한 세금이라, 카페·식당·임대업·교육서비스 등 수익사업에 해당하는 활동이 있으면 매 분기 또는 반기(또는 예정·확정)에 따라 부가세 신고·납부를 해야 해요.

​

고유목적사업 중에서도 일부는 부가세 면세·영세율 규정의 적용을 받을 수 있기 때문에, 사업별·월별로 과세·면세 구분을 정확히 해두어야 신고 오류를 줄일 수 있어요.

​

세무 실무에서는 “언제 무엇을 신고해야 하는가?”라는 질문이 가장 많아요. 이를 해결하는 방법은 연간 일정표를 만들어 두는 것이에요. 예를 들면 다음과 같은 일정표를 참고할 수 있어요:

​

공익법인이라면 세법상 납세협력 의무도 중요해요. 상속세·증여세법은 공익법인에게 출연재산 보고서와 결산서류를 사업연도 종료 후 4개월 이내에 관할 세무서장과 국세청에 공시하도록 요구하고 있어요. 총자산 5억 이상 또는 수입·출연재산 합계 3억 이상 공익법인은 일반 공시, 소규모 공익법인은 간편 공시를 선택할 수 있어요.

​

이 모든 신고·공시 일정은 다음처럼 연간 캘린더로 정리해 두면 좋아요.

시기	주요 업무	대상
1·4·7·10월	부가세 예정·확정신고 (수익사업)	과세 수익사업 있는 법인
3월 말	법인세 확정신고 (수익사업 소득)	비영리법인 전체
사업연도 종료 후 4개월 이내	공익법인 결산서류·출연재산 보고 및 국세청 공시	공익법인

이처럼 일정별로 체크리스트를 관리하면 신고 누락을 예방할 수 있어요. 특히 세무 신고 자료는 월별 영수증·계산서·증빙 파일로 잘 정리해두면 신고 시점에 준비 부담이 크게 줄어요.

 

 

 

4. 비영리법인 연말결산: 재무제표 작성부터 공익법인 공시까지

연말결산은 그동안 회계·세무 작업의 결과물을 한 번에 정리하는 단계예요. 비영리법인의 경우, 고유목적사업·수익사업·관리비를 구분한 손익(수지) 구조와 재무상태, 고유목적사업준비금, 출연재산 변동 내역까지 함께 정리해야 해요.

​

결산 절차를 단계별로 나누면 다음과 비슷해요.

​

1) 사업별 수입·지출 정리

• 고유목적사업, 수익사업, 관리비(일반관리·모금비 등)를 분리해 수입·지출을 집계해요.
• 사업별 손익(수지)표를 작성해 각 사업의 재정 상태를 파악해요.

​

2) 고유목적사업준비금 계상

• 수익사업에서 발생한 이익 중 일부를 법인세법상 고유목적사업준비금으로 적립하면, 해당 금액에 대한 과세를 유예할 수 있어요.
• 준비금은 향후 고유목적사업비로 사용하면서 순차적으로 손금 산입 처리돼야 하고, 사용 내역을 별도로 관리해야 해요.

​

3) 재무제표 작성

• 재무상태표(자산·부채·순자산), 손익계산서, 운영성과표, 현금흐름표를 작성하고, 고유목적사업·수익사업 구분을 주석 등으로 명시해요.
• 수입과 지출뿐 아니라 후원금·보조금의 수익인식 시점과 목적사업비용의 분류, 기부금품의 수입·지출명세 등을 정확히 반영해야 해요.
• 순자산을 기본순자산, 지정적립금, 미지정순자산 등으로 정확하게 구분하여 기재해야 해요.
• 출연재산, 지정기부금, 용도제한 기부금 등 특수 항목은 별도 명세서로 정리해요.
• 결산서 작성이 완료되면 이를 바탕으로 결산 보고 및 이사회 승인 절차를 진행해요.

​

4) 공익법인 결산보고·공시

• 주무관청 제출용 결산서류와 국세청 제출용 결산서류(출연재산 보고, 기부금 명세 등)를 준비해요.
• 사업연도 종료 후 4개월 이내에 세무서 신고와 국세청 홈택스 공시를 마쳐야 하고, 일부 단체는 홈페이지·관보 등에도 공시 의무가 있어요.
• 공익법인 공시 시스템에 자료를 입력할 때는 장부상의 숫자와 공시 서식상의 숫자가 일치하는지 반복해서 검증해야 해요.
• 공시 내용에 오류가 있거나 기한을 넘기면 가산세가 부과될 뿐만 아니라, 단체의 투명성에 타격을 입어 후원이 끊기는 불상사가 발생할 수도 있어요.
• 일정 규모 이상의 공익법인은 외부 회계감사를 받아야 할 의무도 있으니 우리 단체가 대상인지 사전에 체크해야 해요.

​

비영리법인의 연말결산은 단순히 숫자를 맞추는 것을 넘어 한 해의 회계 운영이 법적 기준과 일치하는지 확인하고, 공시를 통해 외부 신뢰도까지 확보하는 과정이에요. 따라서 연말 직전부터 자료를 미리 준비하고 월별 재무 데이터를 정리해 두는 것이 아주 중요해요.

 

 

 

‘후원금→결산→세무신고’가 한 줄로 보이면 비영리회계가 쉬워져요

오늘 함께 비영리법인 경리회계 실무 과정을 보면, 일반 기업보다 훨씬 까다롭고 손이 많이 가는 업무라는 것을 다시 한번 실감하셨을 거예요.

​

비영리회계는 한 번에 다 외우려 하면 너무 어렵게 느껴질 수 있지만, 오늘 알려드린 큰 흐름을 머릿속에 그려두면 훨씬 수월해져요.

​

단, 경리회계 담당자 혼자 모든 걸 완벽하게 하려고 하기보다는, 월별 루틴과 연간 일정표를 만들고, 시스템에 최대한 일을 맡기는 방식으로 접근해 보세요. 월말마다 후원금·보조금 입출 내역을 정리하고, 기부금영수증 발급 대상과 보조금 정산 내역을 확인하는 습관만 길러도, 연말결산과 세무신고는 훨씬 가벼워질 거예요.

​

문제는 챙겨야 할 서류는 산더미 같은데, 정작 실무를 도와줄 솔루션이 부족하다는 점일 거예요. 일반 ERP를 쓰자니 비영리회계 기준에 맞지 않아 엑셀로 이중 작업을 해야 하고, 그렇다고 수기로 관리하자니 공시 오류나 증빙 누락이 늘 불안하실 겁니다.

​

비영리법인의 회계는 비영리 단체만의 특수성을 완벽하게 이해하고 설계된 전용 시스템을 사용해야만 업무의 효율성을 극대화하고 리스크를 최소화할 수 있습니다.

​

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]는 이런 흐름을 염두에 두고 설계된 비영리 전용 회계·세무 관리 솔루션이에요. 고유목적사업·수익사업 구분경리, 후원금·보조금 관리, 기부금영수증 발급, 결산서류·공익법인 공시자료까지 한 번에 연결해서 처리할 수 있도록 도와줘요.

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]

[얼마에요 비영리]에서는 이런 게 가능합니다.

✅ 비전문가도 공익법인 회계기준에 맞게 결산 자료(재무상태표, 운영성과표, 손익계산서 등)를 빠르게 작성할 수 있어요.

✅ 계정과목이나 거래처의 유형에 따라 고유목적사업과 수익사업을 완벽히 구분경리하여 회계 처리합니다.

✅ 카드매출과 세금계산서, 현금영수증 등 매입·매출 데이터를 자동으로 불러오고, 수집된 자료를 바탕으로 부가세 신고서(수익사업을 영위할 경우)를 자동 생성할 수 있어요.

✅ 매월 후원금과 기부금을 일일이 관리할 필요 없이 자동수납(CMS) 기능으로 편리하게 처리할 수 있어요. 또한 기부금 영수증 발급과 신고 파일 생성까지 [얼마에요 비영리]에서 한 번에 해결할 수 있어요.

​

지금 맡고 있는 경리회계 업무가 버겁게 느껴진다면, 이번 기회에 [얼마에요 비영리]를 통해 우리 법인 규모와 특성에 맞는 회계·세무 관리 방식을 한 번 점검해 보세요.

​

시스템이 자리를 잡으면, 담당자는 숫자 입력보다는 재정 전략과 사업 운영을 고민하는 데 더 많은 시간을 쓸 수 있게 될 거예요.

​

아이퀘스트 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리]가 궁금하시다면 지금 빠르게 문의주시기를 바랍니다.

아래 배너 클릭 후 '구매상담'을 신청하시면 1:1 도입 상담 및 무료 체험 안내를 받아보실 수 있습니다.

 

👉 위 배너를 클릭하면 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리] 간편하게 문의하는 페이지로 이동합니다.

 

👉 위 배너를 클릭하면 비영리 전문 ERP [얼마에요 비영리] 기능 소개 페이지로 이동합니다.

 

 

 

지금 이 글을 읽고 계신 분들은 아래 글도 함께 읽고 있습니다.

비영리법인 회계 용어 핵심 정리

비영리법인 회계 용어 총정리｜경리·회계 담당자를 위한 기본 개념 정리

 

 

비영리 맞춤 회계 업무별 동영상 가이드

비영리 맞춤 회계 실무 가이드｜업무별 동영상으로 바로 따라하기!